Магистерская программа "Экономика и финансы здравоохранения" направлена на подготовку высококвалифицированных специалистов в области управления финансами медицинских организаций и системы здравоохранения, обладающих глубокими фундаментальными знаниями и широким кругом междисциплинарных компетенций. Магистерская программа реализуется совместно с Министерством здравоохранения Российской Федерации и Федеральным фондом обязательного медицинского страхования. Сформирована с учетом профессиональных стандартов в области организации здравоохранения, управления проектами государственно-частного партнерства, а также квалификационного справочника должностей руководителей, специалистов и служащих.
Магистерская программа финансовой специализации. На этом направлении вузы готовят финансовых менеджеров, финансовых аналитиков, банковских специалистов.